2018年4月19日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，美国北卡罗莱纳州立大学的Rodolphe Barrangou、Alexandra Crawley和AgBiome公司的James Henriksen开发出一种被称作CRISPRdisco（CRISPR discovery）的自动化生物信息学工具，该工具旨在提高日益多样化的CRISPR-Cas基因组编辑系统的实用性和可用性，并帮助科学家们鉴定出基因组中的CRISPR重复序列和cas基因。这种可免费获得的软件提供标准化的高通量分析方法来检测CRISPR重复序列并准确地确定它们的类别、类型和亚型。相关研究结果于2018年4月9日在线发表在CRISPR Journal期刊上，论文标题为“CRISPRdisco: An Automated Pipeline for the Discovery and Analysis of CRISPR-Cas Systems”。Barrangou也是CRISPR Journal期刊的主编。

CRISPR/Cas系统类型分布图，图片来自CRISPR Journal, doi:10.1089/crispr.2017.0022。

在这项研究中，这些研究人员利用CRISPRdisco对来自美国国家生物信息技术中心参考序列数据库（NCBI RefSeq database）的2777个完整基因组进行分析，从中鉴定潜在的CRISPR-Cas系统，并对它们进行分类。他们强调了能够区分完整的和不完整的CRISPR系统的重要性，确定了潜在完整的和功能性的CRISPR-Cas系统之间在体内的关联性，并且利用计算机模拟（in silico）确定了CRISPR-Cas多样性。重要的是，所有人都可通过GitHub网络平台（一个面向开源及私有软件项目的托管平台）获得这个软件，并且该软件能够让新手分析和描述各种基因组数据集中的CRISPR-Cas系统。

CRISPR Journal期刊执行编辑Kevin Davies博士说，“新的生物信息学工具、程序和数据库正在协助推动CRISPR革命，而且我们很乐意为验证其中的一些重要平台提供论坛。”（生物谷 Bioon.com）

参考资料：

Crawley Alexandra B. , Henriksen James R. , and Barrangou Rodolphe. CRISPRdisco: An Automated Pipeline for the Discovery and Analysis of CRISPR-Cas Systems. CRISPR Journal, Published Online:9 Apr 2018, doi:10.1089/crispr.2017.0022